Den Botanischen Garten der Universität Hamburg (seit 2012 "Loki-Schmidt-Garten") unterteilt sich in zwei Standorte: das Freigelände in Klein-Flottbek und die Tropengewächshäuser am Bahnhof Dammtor (Öffentliche Grünanlage "Planten un Blomen").
Inhaltlich und gestalterisch ist das Freigelände des Botanischen Gartens in drei Abteilungen gegliedert, die Pflanzengeographie (GEO), die Pflanzensystematik (SYS) und die Abteilung Pflanze und Mensch (MEN).
Während es sich bei der Pflanzengeographie und dem Pflanzensystem um Abteilungen handelt, in denen die Darstellung natürlicher Phänomene, wie geographische Verbreitung und systematische Verwandtschaft im Vordergrund steht, stellt die Abteilung Pflanze und Mensch ein buntes Mosaik aus verschiedenen Themengärten dar. Das gemeinsame Kennzeichen dieser Gärten besteht darin, daß in ihnen Aspekte dargestellt/thematisiert werden, die sehr eng mit dem Leben des Menschen und der menschlichen Gesellschaft verbunden sind.
In der Abteilung Pflanzengeografie wurden die Pflanzen in erster Linie nach geografischen bzw. geobotanischen Gesichtspunkten ausgewählt. Ausgehend von den mitteleuropäischen Klimaverhältnissen standen dabei die Gewächse aus den gemäßigten Klimaregionen der Erde, also aus Nordamerika und Eurasien, sowie aus dem südlichen Südamerika im Vordergrund. In einer separaten Abteilung, dem Alpinum, werden Pflanzen aus den Hochgebirgen Europas gezeigt.
Das System im Botanischen Garten ist als Phylogenetische Uhr konzipiert und besitzt daher, einem Zifferblatt entsprechend, eine kreisrunde Form. Die 0- bzw. 12-Uhr-Position des Zifferblattes befindet sich im Norden der Anlage, also vor der Granitstein-Mauer. Bei den 0-, 3-, 6- und 9-Uhr-Positionen ist das Zifferblatt durch ein Wegekreuz in vier gleich große Sektoren untergliedert, die für die vier bzw. fünf große Verwandtschaftsgruppen der Samenpflanzen stehen.
Die Anordnung der Pflanzenordnungen innerhalb der Sektoren orientiert sich an den aktuellsten molekularsystematischen Ergebnissen der so genannten Angiosperm Phylogeny Group (APG). Dabei handelt es sich um ein Team von bis zu 30 Fachwissenschaftlern, die sich in den vergangenen 20 Jahren mit der verwandtschaftlichen Gliederung des Pflanzenreiches beschäftigt haben.
